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《黄帝内经》基于先秦时期的“一分为三”理念构建的“三阴三阳”思维模式，广泛地应用于构建的生命科学知识体系，既是五运六气理论发生的必须思维路径，也是“六气理论”中的核心内容，舍此则无法予以识读。
构建“六气”理论
《内经》运气学说中的“六气理论”，又有“主气”和“客气”之分，但都是在“三阴三阳”思维模式之下，表达每年六步之气运行变化的正常状态（主气）和偶发的异常状态（客气）。都是将一年十二个月分为六个时间阶段，始于大寒节，每过60.875天为一个时间阶段。二者都指自然界的风气（属木、厥阴）、热气（君火、少阴）、暑气（相火、少阳）、湿气（属土、太阴）、燥气（属金、阳明）、寒气（属水、太阳）六种气候。
分别主持一年六个季节常态的气候被称为“主气”，又称为“主时之气”。根据《素问·至真要大论》记载，“主气”的“三阴三阳”属性变化是按五行相生为序排列：初之气“厥阴”，此时的气候特点为“风”（属性为“木”，气候逐渐转温，万物即将复苏）；二之气为“少阴”，此时的气候特点为“热”（属性为“火”，又称“君火”，气候明显转热，万物欣欣向荣）；三之气为“少阳”，气候特点为“暑”（属性为“火”，又称“相火”，此时为全年气温最高，万物生长茂盛）；四之气为“太阴”，气候特点为“湿”（属性为“土”，此时气温高，湿度大，万物化育）；五之气为“阳明”，气候特点为“燥”（属性为“金”，此时气温变凉，湿度小而干燥，万物凋零）；终之气为“太阳”，气候特点为“寒”（属性为“水”，此时为全年气温最低、最寒冷，万物蛰伏敛藏）。在此“三阴三阳”思维模式下，可以演绎逐年“主气”的六步变化特征、物候特征、季节性疾病流行特征，乃至临床用药特征。
可能出现在一年六个季节的异常气候状态，被称为“客气”。就“客气”而言，其“三阴三阳”属性变化特征是先三阴，后三阳，按一、二、三模糊量化之序运行。运行次序是：一厥阴风木，二少阴君火，三太阴湿土，四少阳相火，五阳明燥金，六太阳寒水。此即原文所说的，客气六步“上下有位，左右有纪。故少阳之右，阳明治之；阳明之右，太阳治之；太阳之右，厥阴治之；厥阴之右，少阴治之；少阴之右，太阴治之；太阴之右，少阳治之”（《素问·六微旨大论》）。用“三阴三阳”思维模式，可以逐年的、周而复始地标记六年为一个周期的、每一年六节气位（每一气位为60.875天，从大寒节的交司时刻起步）的阴阳属性，这就是“运气理论”中每年的六步客气。运气学说中的“六气”理论，还有“客主加临”内容。
构建“标本中气”理论
《内经》又用“三阴三阳”标记风、寒、暑、湿、燥、火六气的阴阳属性，构建了独特的“标本中气”理论。本，即事物的本体、本质，此指风、寒、暑、湿、燥、热六气，因为六气是气候物化现象产生的根源，故谓六气为本。标，标志、标象、符号标记，即三阴三阳，是用以表示或者标记六气的标志，以便于人们掌握和认识六气。中，即中见之气，是与标本相互联系，且与标为表里关系者即为中气。此即“运气理论”中用以推演每年六步之气的运行变化，即所谓“少阳之上，火气治之，中见厥阴；阳明之上，燥气治之，中见太阴；太阳之上，寒气治之，中见少阴；厥阴之上，风气治之，中见少阳；少阴之上，热气治之，中见太阳；太阴之上，湿气治之，中见阳明。所谓本也，本之下，中之见也，见之下，气之标也。本标不同，气应异象”（《素问·六微旨大论》）。基于十二月太阳历法一年十二个月分为六个时段（六节）的天文背景，“标”与“中气”的关系，借用了经络理论中的“表里”联系的内涵，因而，但凡运气家谈论六气之“标”与“中气”关系时，就用“表里”术语表达。由此可见，《内经》运气理论中的“标本中气”理论与经络理论是脱离不了干系的，这也是为何明代张介宾为何径直表达脏腑经脉之间的标本关系，认为“六气为三阴三阳之本，下之三阴三阳，为六气之标；而兼见于标本之间者，是阴阳表里之相合，而互为中见之气也。其于人之应之者亦然。故足太阳、少阴二经为一合，而膀胱与肾之脉互相络也……手阳明、太阴为六合，而大肠与肺脉互相络也。此即一表一里而阳中有阴，阴中有阳之义”（《类经·运气类》）。脏腑为“本”，其所属的经脉为“标”，而“中气”即为与之为表里关系的脏腑及其经脉，如“肺”为“本”，手太阴经为“标”，“中气”即为与之为表里关系的手阳明大肠经，其余类此。
《内经》基于“三阴三阳”思维模式所构建的“标本中气”理论，有其显著的临床实践特征，就以六淫致病的临床实例为基础，总结出六气为病的致病规律，以及如何据此而治疗。如“少阳太阴从本，少阴太阳从本从标，阳明厥明，不从标本，从乎中也……是故百病之起，有生于本者，有生于标者，有生于中气者。有取本而得者，有取标而得者，有取中气而得者，有取标本而得者，有逆取而得者，有从取而得者”（《素问·至真要大论》）即是这一观念的集中体现。其中“生于本”“生于标”“生于中气”讲述的是六淫所致疾病的发生、发展变化规律；而“取本”“取标”“取中气”“取标本”“逆取”“从取”则是根据所总结的致病规律而制定的相关治疗用药思路。东汉张仲景基于上述观念，而于《伤寒论》中创立六经辨证思路，践行了《内经》创立的“六气标本”理论，并体现于相关条文和所施用的方药之中。
构建六节气位人体脉象特征模型
无论是生理或者病理的脉象，都是人体内部气化状态通过脉象状态体现于外的表征。既然可以用“三阴三阳”标记人体的经脉、标记人体的脏腑，那么就一定能够标记人体脏腑经脉在不同时间区位的气化状态，也就能够标记不同时间区位人体气化状态所表现的脉象。这就是“脉至何如……厥阴之至，其脉弦；少阴之至，其脉钩；太阴之至，其脉沉；少阳之至，大而浮；阳明之至，短而；太阳之至，大而长。至而和则平，至而甚则病，至而反者病，至而不至者病，未至而至者病，阴阳易者危”（《素问·至真要大论》）。此节就是应用“三阴三阳”六气模型，讲述六脉与六气（六节）对应关系。认为六气之胜的相关气候变化，必然影响人体脏腑经脉的气化活动而应合于人体之脉象，但六节气位的应时脉象，总以“至而和则平，至而甚则病，至而反者病，至而不至者病，未至而至者病，阳阴易者危”为基本规律，也即为“而至者和，至而不至，来气不及也；未至而至，来气有余也”（《素问·六微旨大论》）。所谓“阴阳易者危”，即如张志聪所释，“三阴主时而得阳脉，三阳主时而得阴脉者危”（《素问集注·卷二十四》）。
构建六节时位疾病流行谱模型
六节时位与相应的六气活动状态有关，所以，“三阴三阳”模式在《黄帝内经》六气理论中的应用，表现在主气六步与客气之司天、在泉两套理论之中。
其一，在主气六步理论中的应用。认为六气异常就成为致病因素，即六淫邪气，故六气理论的应用，主要针对的是外感疾病。认为春季为厥阴风木当令，故易患风温病。夏季为少阴君火与少阳相火暑热司令，故临症多见 头晕、发热、汗出、咳嗽等症。长夏为太阴湿土当令，易发湿瘟之疾。秋季阳明燥金当令，易患温燥或凉燥。冬季太阳寒水主司，气候寒冷，病多伤寒（《素问·六微旨大论》）。
其二，在客气（司天、在泉）理论中的应用。认为客气是随年份变化而不断迁移的气候，虽乃六步，但对气候影响最大者，莫过于司天之气和在泉之气，所以临床应用中通常以此二者为主而论其对发病及治疗的影响。如“清气大来，燥之胜也，风木受邪，肝病生焉；热气大来，火之胜也，金燥受邪，肺病生焉；寒气大来，水之胜也，火热受邪，心病生焉；湿气大来，土之胜也，寒水受邪，肾病生焉；风气大来，木之胜也，土湿受邪，脾病生焉。所谓感邪而生病也。乘年之虚，则邪甚也；失时之和，亦邪甚也。遇月之空，亦邪甚也。重感于邪，则病危矣。有胜之气，其必来复也”（《素问·至真要大论》）。
构建六节时位流行疾病谱的治疗用药思路
《黄帝内经》应用“三阴三阳”思维模式所构建六节时位流行疾病谱治疗用药的思路，是依据六气淫胜规律而予以组方用药的。无论是主气还是客气，相同特点的气候淫胜之时，遵循的用药思路如下。
其一，“厥阴之胜，治以甘清，佐以苦辛，以酸泻之”之用药原则（《素问·至真要大论》）。张元素的《医学起源·六气方治·风气方》认为，可针对临床病证特点分别选用防风通圣散、灵砂丹、神仙换骨丹、不换金丹、花蛇续命汤、加减冲和汤、防风天麻散、祛风丸、大通圣白花蛇散、活命金丹、至宝丹、牛黄通膈汤等。
其二，“少阴之胜，治以辛寒，佐以苦咸，以甘泻之热气大来，火之胜也，金燥受邪，肺病生焉”之用药原则（《素问·至真要大论》）。张元素在《医学起源·六气方治·火气方》中针对少阴君火热气淫胜所发生的不同病证，拟定以下方药以供选择：凉膈散、黄连解毒汤、三一承气汤、八正散、洗心散、调胃承气汤、大承气汤、柴胡饮子、白虎汤、桃仁承气汤、神芎丸。
其三，“太阴之胜，治以咸热，佐以辛甘，以苦写之”之用药原则（《素问·至真要大论》）。张元素结合相关的疾病流行状态，拟定了葶苈木香散、白术木香散、大橘皮汤、桂苓白术丸、六一散、五苓散、赤茯苓丸、人参葶苈丸、海藻散等方药，以供临床治疗关系病证时选择（《医学起源·六气方治·湿土方》）。
其四，“少阳之胜，治以辛寒，佐以甘，以甘写之”组方用药原则（《素问·至真要大论》）。张元素结合相关的疾病流行状态，拟定了白虎汤、桂苓甘露饮、桂苓白术散、益元散、竹叶石膏汤、化痰玉壶丸、四君子汤、白术散、小柴胡汤、升麻葛根汤等方药，以供临床治疗关系病证时选择（《医学起源·六气方治·暑热方》）。
其五，“阳明之胜，治以酸温，佐以辛甘，以苦泄之”组方用药原则（《素问·至真要大论》）。张元素结合相关的疾病流行状态，拟定了脾约丸、润肠丸、当归润燥汤、橘杏丸、七宣丸、麻仁丸、神功丸、厚朴汤、七圣丸、犀角丸等方药，以供临床治疗关系病证时选择（《医学起源·六气方治·燥气方》）。
其六，“太阳之胜，治以甘热，佐以辛酸，以写之”组方用药原则（《素问·至真要大论》）。张元素结合相关的疾病流行状态，拟定了大己寒丸、四逆汤、附子理中丸、胡椒理中丸、理中丸、桂附丸、姜附汤、加减白通汤、二姜丸、术附汤等方药，以供临床治疗关系病证时选择（《医学起源·六气方治·寒气方》）。
这是前人依据运气理论指导临床治疗用药的实践结晶，由于时间的变迁，气运特点也会因之而有所区别，因此在临床应用前人的经验时，要遵循《素问·举痛论》所云“善言天者，必有验于人；善言古者，必有合于今；善言人者，必有厌于己”的学习方法和要求，灵活对待，不可拘执。
可见，“三阴三阳”思维模式，既是《黄帝内经》五运六气理论构建的思维基础，也是该知识板块的核心要义，无论是学习还是应用运气理论指导临床治疗用药，舍此思维路径，不但寸步难行，而且丢失了该理论的灵魂和精髓。（张登本 李翠娟）
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