中医如何传承和发展，人类新医学如何构建？这需要对中医药的根、中医的哲学、中医的科学进行深入研究。
传统中医是中国古代科学的代表。中医方法论是在元气论基础上以天人合一整体论为手段，用阴阳五行原理等，辩证逻辑思维为主，认识人体内外各种相互关系，来对疾病诊治的方法。
现代西医是现代的科学成果。西医方法论是在原子论基础上将人体按照还原论为手段，用功能结构原理等，机械逻辑思维为主分析人体生理变化，来对疾病诊治的方法。
中医包含许多古代天文、地理、人文等科学知识。
《黄帝内经》中“圣人之为道者，上合于天，下合于地，中合于人事”、“故治不法天之纪，不用地之理，则灾害至矣”等；孙思邈《大医习业》大医三层次：医道之始－生理之人，医道必备－社会之人，医道无碍－天人之人。
《黄帝内经》中关于支干病变，张仲景六经病欲解时，都是以干支为依据。干支历法建立在中国古代以地球为中心，宇宙观为“天”的理论基础上，观察一切事物生长壮老已周期规律。这也是中医“天人合一”中的天与人的关系之根。
人为万物之灵，心为人身之主，意为人身之宗，故历代医家都推崇“医者意也”；而今无论中医还是西医都缺少对人心意的重视，但这正是天人合一整体论中“人”的重要部分。
在临床诊疗时中医的“证”是比西医“病”更高层次整体性，所以钱学森从复杂性科学出发认为：“中医理论又恰恰与系统科学完全融合在一起……中医的看法又跟现代科学中最先进、最尖端的系统科学的看法是一致的。”可见，天人合一的中医属复杂性科学范围，中医的方法论符合现代前沿科学方法论。
世界卫生组织宣布医学发展方向应从“疾病医学”向“健康医学”发展，从重治疗向重预防发展等，说明西医面临重大调整和转向。中医将立足传统结合现代科学技术实现传承与发展的中医现代化，同时将以中医为纲，西医为目，探索构建人类新医学——和谐医学。
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