幽门螺杆菌基因的检测与分型
中华医学检验杂志 2000年第1期第23卷 简报
作者:杨学文 王礼文 陈云峰 缪界平 陈亚军
单位:杨学文(210029 南京,江苏省中医院);王礼文(210029 南京,江苏省中医院);陈云峰(210029 南京,江苏省中医院);缪界平(210029 南京,江苏省中医院);陈亚军(210029 南京,江苏省中医院)
我们用幽门螺杆菌(Hp)空泡毒素(vacA)和细胞毒相关蛋白(cagA)基因检测以及vacA基因分型的聚合酶链反应(PCR)方法,并对幽门螺杆菌vacA基因型和cagA状态的关系作了调查,报告如下。
一、材料和方法
1. 标本:48株Hp临床分离株和124份用我院自制采样器所取Hp阳性胃粘液标本[1],经PCR检测Hp16S rRNA基因和尿素酶试验以及14C呼气试验确定为Hp阳性的标本。以上取样的172位Hp阳性患者中,经内窥镜取样病检诊断为萎缩性胃炎(AG+CAG)的患者为49例,浅表性胃炎(SG+CSG)的患者为64例。
2.试剂:Taq DNA聚合酶、PCR markers为Promega产品。
3.引物:见参考文献[2]设计。
4.DNA提取:见参考文献[1]。
5.Hp cagA基因PCR检测:用引物cagA-F和cagA-R进行PCR反应,扩增程序为94℃预变性3 min,94℃20sec、60℃20 sec、72℃ 30 sec,共35个循环,最后72℃延伸5 min。
6.Hp vacA基因及其亚型的检测:用相应引物进行PCR扩增,进行vacA基因检测时退火温度为55℃,vacA基因型检测时退火温度为58℃,其余反应条件同上。
二、结果
1. cagA、vacA基因检测结果:172份Hp-DNA标本共检出vacA阳性172份,阳性率100%;cagA阳性93份,阳性率54.07%,其中49例CAG患者的标本cagA阳性47例(95.92%),64例CSG患者的标本中cagA阳性28份(43.75%),两者差异有显著意义(P<0.05)。
2.vacA基因型检测结果:利用不同的引物分别对172份Hp-DNA标本进行扩增,中间区域型m1和m2分别为80和92例,两者差异无显著意义(P>0.05);信号序列型s1a、s1b、s2分别为82、68、22,s1a与s1b之间无明显差异(P>0.05),s1a、s1b、s1(s1a+s1b) 型明显多于s2型(P<0.05)。检出所有的6种信号序列/中间区域组合型,s1b/m1和s1a/m2分别为48和52例,明显多于其他基因型(P<0.05),s2/m1仅为2例,明显少于其他基因型(P<0.01),差异有非常显著意义。
3.Hp vacA基因型与cagA基因的关系:将Hp的vacA中间区域型和信号序列型的可能的几种组合(s1/m1、s1/m2、s2/m1、s2/m2)与cagA状态进行统计分析,s1/m1、s1/m2型的cagA阳性数分别为45和48,两者无显著差异,s2/m1、s2/m2型的cagA阳性数均为0,结果显示,s1/m1、s1/m2型的cagA阳性数显著高于s2/m1、s2/m2型。
参考文献
1 王礼文, 杨学文, 李克涓, 等.非损伤性胃内采样法用于诊断幽门螺杆菌感染.中华医学检验杂志, 1998, 21: 243.
2 Ito Y, Azuma T, Ito S, et al. Analysis and typing of the vacA gene from cagA-positive strains of Helicobacter pylori isolated in Japan. J Clin Microbiol,1997, 35: 1710-1714.
收稿日期:1999-04-15