多基因单链构象多态性技术在大肠癌多基因突变联合测定中的应用
中华医学检验杂志 1998年第6期第0卷 论著摘要
作者:李欣 俞守义 丁彦青 Hongming Q. 周军 郑树
单位:510515 广州第一军医大学流行病学教研室(李欣、俞守义),病理学教研室(丁彦青、周军);Cancer center, The university of Texas (Hongming Q.);浙江医科大学肿瘤研究所(郑树)
多基因单链构象多态性(MSSCP)是一种与多基因聚合酶链反应(PCR)联合应用,一次性快速测定多基因突变的方法[1]。本研究建立了测定APC基因突变聚集区域(MCR)和K-ras第12/13密码子突变的MSSCP技术。
一、材料与方法
1.样本收集:收集34例确诊的散发性大肠癌组织和21例正常人组织,同时收集30例确定有APC(MCR)或K-ras(第12/13密码子)基因突变和27例无突变散发性大肠癌组织。
2.多基因SSCP分析:(1)引物设计与合成:按多基因PCR引物设计原则,在APC基因MCR区域设计3对引物,在K-ras基因第12/13密码子两侧设计1对引物。(2)多基因PCR扩增。(3)聚丙烯酰胺凝胶电泳:5μl多基因PCR产物,加3倍体积上样缓冲液,煮沸10分钟,猝冷 2~3分钟,8%聚丙烯酰胺凝胶(29∶1)电泳4~5小时。银染、干燥保存和分析异常泳带。
3.真实性评价方法[1]。
二、结果
1.多基因PCR及MSSCP方法的建立:将4对引物混合,进行PCR扩增。空白对照未见产物,组织标本可见4条清晰条带。MSSCP结果经银染,由单基因SSCP单链定位,在相应区域可见单链条带正常或异常泳动。
2.真实性评价:MSSCP灵敏度、特异度分别为96.7%(29/30)和88.9%(24/27);各单基因SSCP特异度分别为100%(27/27)和96.3%(26/27),而灵敏度分别仅为40%(12/30)和70%(21/30),并联分析后的灵敏度为100%,特异度为96.3%(26/27)。
3.散发性大肠癌34例临床标本MSSCP测定:K-ras(12/13)阳性8例(23.5%);APC(MCR)阳性5例(14.7%);K-ras+APC阳性8例(23.5%)。共计阳性21例(61.8%),APC(MCR)突变总检出率为38.2%,K-ras第12/13密码子突变总检出率为47.1%。21例正常组织未见突变。
三、讨论
检测肿瘤相关基因的突变,有望在早期发现肿瘤高危个体或临床前期病人。目前单基因突变测定阳性率偏低,甚至低于30%[2],限制了这类方法的实际应用。国外于1992年提出多基因突变联合测定的策略,以提高阳性检出率[3],但多个基因突变测定,过程繁琐,费用昂贵。MSCCP方法能有效地解决这类问题。真实性分析表明MSSCP方法在一次性快速测定基础上,灵敏度和特异度基本一致于单基因测定后的并联结果。对临床标本进行MSSCP测定,突变检出率达61.8%,而单基因测定,检出率在38.2%~47.1%,表明MSSCP能一次性快速而有效地提高基因突变的检出率。本研究方法仍有待于在更大样本或前瞻性观察研究中作进一步评价。
参考文献
1 曾光,主编.现代流行病学方法与应用.北京医科大学中国协和医科大学联合出版社.1993.61-74.
2 黄健,郑树,金胜航,等.散发性大肠癌APC基因突变研究.中华肿瘤杂志,1996,8:41-43.
3 Michael jB. Translational research and epithelial carcinogenesis: molecular diagnostic assays now-molecular screening assays soon? J Natl Cancer Inst, 1995,87:1041-1043.
(收稿:1998-04-03 修回:1998-08-27)