男性不育症患者的体格检查包括全身检查和生殖器官的检查两部分。
全身检查：应测量身高、体重、指距、血压。检查心、肝、肺等脏器是否有严重慢性疾病。观察第二性征，包括体型、毛发分布(腋下、躯体、面部、会阴部)和青春期发育程度，有无男性乳房女性化、有无嗅觉异常等。如无胡须、无喉结、阴毛及腋毛稀疏、发音高尖等体征，应考虑为男性第二性征不发育，有曲细精管发育不全(即克氏综合征)的可能。如血压高、向心性肥胖、多毛、腹部有紫纹等，应考虑为皮质醇增多症，可致不育。
生殖器官检查：一般宜直立位或平卧位进行，检查有无生殖器官畸形、尿道上裂、下裂，有无阴茎海绵体硬结，阴茎大小(成年人长约7～10cm，勃起时可增加1倍)。有无严重的包茎、炎症、肿瘤等。睾丸大小(成年人睾丸体积平均19 8ml，小于12ml示睾丸发育不良，小而软的睾丸常出现少精子或无精子)。检查附睾有无增厚、触痛或囊肿。输精管是否缺如。病人站立、憋气、增加腹压以检查有无精索静脉曲张，阴部有无鞘膜积液。直肠指诊，检查前列腺形态、大小、质地、有无硬结，对慢性前列腺炎，可做前列腺按摩液显微镜检查，如白细胞增多或出现红细胞，可以确定诊断。
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