在月经周期中，随着雌孕激素的变化，可以引起阴道上皮周期性改变，这种改变在阴道上段最为明显。排卵前，阴道上皮在雌激素的影响下，底层细胞增生，渐渐演变成中层与表层细胞，使整个上皮的厚度增加，表层细胞出现角化，其程度在排卵期最为明显。细胞内富有糖原，糖原分泌后，经过寄生在阴道内的一种细菌——阴道杆菌的分解而成乳酸，使阴道内保持一定的酸度，可以防止致病细菌的繁殖。排卵后，阴道上皮细胞在孕激素的作用下，发生大量脱落，脱落的细胞多为中层细胞或角化前细胞。临床上常根据阴道脱落细胞的变化作为了解卵巢功能的方法。
在月经周期中，除输卵管肌肉的节律性收缩外，输卵管上皮也有相应的变化。在卵泡期，由于雌激素的影响，纤毛细胞变宽大，无纤毛细胞较细小，细胞内无分泌颗粒。到黄体期，受孕激素影响，纤毛细胞变短小，无纤毛细胞则突出于表面，并含有大量糖原，成为分泌细胞。
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