很多患者单用干扰素抗乙肝病毒的疗效不佳，因此有人采用类固醇脱离疗法，激发乙肝病毒复制后再用干扰素，有的则与其他药物联用以增强抗病毒作用。绝大多数联合用药不仅使乙肝病毒的e抗原消失，使e抗体的出现增高，而且e抗原阴转和e抗体的出现时间提前。
干扰素多数是与其他抗病毒药联合使用，还有与免疫调节药和强的松等联合，日本还采用干扰素与中药小柴胡汤、桂枝茯苓丸和甘草酸合并使用，近年还用重组干扰素与肿瘤坏死因子联用。总病例155例，使乙肝病毒e抗原完全转阴数达75例，e抗原总转阴率达48.4%。事实上比单用干扰素的疗效要好。但是1990年迪比塞格利报道，如把重组干扰素和干扰素联合应用仅有很小抑制作用，且副作用较多。二药合并既无叠加作用，又无协同作用，而副作用增加，且乙肝病毒去氧核糖核酸、去氧核糖核酸聚合酶及e抗原无1例阴转，所以认为该2种重组干扰素的联用在消灭乙肝病毒中还可能存在拮抗作用。
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