口腔不良习惯是指生长发育期儿童在一定时间内有意识或无意识地反复做一相同的动作，并持续下去，如吮手指、吐舌、咬指甲等。在各类错颌畸形病因中，口腔不良习惯约占1/4。家长发现儿童有不良习惯时，应及时说服教育，使儿童认识不良习惯的害处，以争取自动停止。另外，改善环境，转移儿童的注意力，也有助于改变不良习惯。绝不可采用恐吓或惩罚等方式，因为这样做不仅不能取得患儿的合作，反而增加了患儿的心理负担，造成心理损害，同时由于精神作用可能使某些不良习惯行为变得更加严重。口腔不良习惯如在5～6岁以前改正，错颌可以自行消失，若在7～10岁改正，其所导致的牙颌畸形只有一部分可以自行消失。若畸形仍不消失，可用矫治器进行矫治。 导致牙颌畸形的不良习惯不先破除，则牙颌畸形不可能得到彻底的矫治，因为矫治后，虽然暂时可以取得疗效，但不良习惯没有彻底纠正，畸形仍可复发。更要注意的是，一种不良习惯，又可引起继发第二种不良习惯。
吮指：1岁半以前吮指是婴儿正常的生理现象，不必制止。3岁时仍有吮指习惯者，其错颌大都在前牙区，只要停止吮指习惯，一般畸形会自动消失。如果超过3岁半，甚至延长到替牙期，牙颌畸形将更加明显。婴儿时期可在吮吸的手指上涂抹苦味药或戴手套，睡觉前饮用温牛奶或听轻音乐，有助于婴儿减轻对吮吸的欲望。除了吮指外，尚有吮物、咬指甲、咬笔头等不良习惯。年龄稍大儿童除了说服教育外，必要时可戴唇挡矫治器。若引起上颌前突、深覆盖、牙弓狭窄等，可戴前庭盾。若由于吮指习惯引起前牙开颌并继发性吐舌习惯者，可戴腭刺矫治器。
吐舌：吐舌、舔牙和伸舌三种习惯，由于性质不同，造成的错颌畸形不同，因而矫治的方法也不同。吐舌习惯可采用腭刺活动矫治器防止舌前伸，不能吐出，久之即可矫治吐舌不良习惯，牙齿也能正常萌出。舔牙习惯除了用腭刺矫治器外，如上门牙向唇面倾斜太明显，可加双曲唇弓内收上前牙。年幼儿童吐舌习惯矫正后，因为向前的推动力已消除，唇向的前牙可自行复位。伸舌习惯可造成前牙开颌及下颌前突，一般采用腭刺矫治器，必要时也可用颏兜及头帽矫治。如果婴儿在出牙前伴有伸舌吞咽习惯，尽量避免人工哺乳。必须人工哺乳者，乳胶奶嘴不要过长，用仿真奶嘴。同时也不要长期使用奶瓶，适时改用匙勺喂食物。
咬唇：咬下唇增加上前牙唇向压力及下前牙舌向压力，造成上前牙唇向倾斜，出现牙间隙；下前牙舌向移位出现拥挤；上下前牙形成深覆盖，颜面表现为上前牙前突，开唇露齿。幼年儿童可用前庭盾，使唇牙隔离，防止吮咬，早晚进行唇肌训练。如果前庭盾不能固位，可用胶布封闭嘴唇。前牙改观后，唇肌张力加强了，则前庭盾可自行在口内固位。
用口呼吸：正常呼吸为鼻呼吸，若鼻呼吸困难，如扁桃体肥大、鼻甲肥大、鼻中隔弯曲、鼻炎等引起鼻道全部或部分阻塞，则改为用口呼吸。用口呼吸的儿童，须首先检查和治疗鼻咽部疾病，去除诱因。疾病治疗后仍有用口呼吸习惯，需随时提醒患儿闭口，用鼻呼吸，也可用口罩或前庭盾矫正。前庭盾可作唇肌锻炼以增强其张力，使口唇能自然闭合。
偏侧咀嚼：纠正偏侧咀嚼，应先去除病因，如治疗龋病，修复缺牙或用功能性缺隙保持器。加强废用侧咀嚼肌锻炼，使用该侧咀嚼，全口进行调磨，使其能咀嚼自如。及早戒除偏侧咀嚼，可改善颜面偏斜畸形。