乙肝病毒最常用的血清学标志是: 乙肝表面抗原(HBsAg)、乙肝表面抗体(抗-HBs)、乙肝e抗原(HBeAg)、乙肝e抗体(抗-HBe)、乙肝核心抗体(抗-HBc)。即两对半，或称乙肝病毒5项。
(1)乙肝表面抗原：是乙肝病毒的外壳蛋白，本身不具有传染性，但它的出现常伴随乙肝病毒的存在，所以它是已感染乙肝病毒的标志。它可存在于患者的血液、唾液、汗液、泪水、鼻咽分泌物、精液及阴道分泌物中。在感染乙肝病毒后2～6月，当丙氨酸氨基转移酶升高前2～8周时，可在血清中测到阳性结果。急性乙型肝炎患者大部分可在病程早期转阴；慢性乙型肝炎患者该指标可持续阳性。
(2)乙肝表面抗体：是对乙肝病毒免疫和保护性抗体。常在乙型肝炎恢复后期出现阳性。此时乙肝表面抗原已转阴数月。血清中乙肝表面抗体滴度越高，保护力越强，持续时间也越长(3～5年以上)。再次感染乙肝病毒后,乙肝表面抗体可在2周内滴度明显升高。但也有乙肝表面抗体阳性而又发生乙型肝炎者,这种情况可能为不同亚型感染。90%接受乙肝疫苗注射者的乙肝表面抗体可转阳。极少数情况下表面抗原和抗体均为阳性，常见于不同亚型的乙肝病毒感染；免疫功能低下的患者，血液中的乙肝表面抗原；或是感染了S基因发生了变异的乙肝病毒。
(3)乙肝e抗原：在乙肝病毒感染后表面抗原阳性同时或其后数日可测得乙肝e抗原。乙肝表面抗原在血内高峰期亦是乙肝e抗原的高峰期。在肝炎症状出现后10周内逐渐下降，在乙肝表面抗原转阴前可先转阴。如果乙肝e抗原阳性，则可发展为慢性持续性感染。乙肝e抗原阳性说明乙肝病毒在体内复制活跃，传染性强。在慢性乙型肝炎患者中，乙肝e抗原指标转阴而乙肝e抗体转阳过程中临床上可出现明显的肝功能恶化。极个别情况下可见乙肝表面抗原阴性而乙肝e抗原为阳性。
(4)乙肝e抗体：在乙肝e抗原转阴后数月出现乙肝e抗体阳性。乙肝e抗体阳性预示患者的传染性已显著或相对降低。病毒复制程度已降低或明显缓解。近年发现个别乙肝e抗体阳性，但乙肝病毒核糖核酸(HBVDNA) 亦为阳性者的病情迁延不愈，这是感染了变异的乙肝病毒所致，临床上不可忽视。
(5)乙肝核心抗体：通常在乙肝表面抗原出现后3～5周肝炎症状出现前即可在血清中检出。高滴度的乙肝核心抗体阳性常标志乙肝病毒正在复制，有传染性。可持续存在数年至数十年。低滴度的乙肝核心抗体表示乙肝病毒既往感染。
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