1.阴茎部尿道的O、A期肿瘤有主张行经尿道的肿瘤电切术。由于临床分期往往不够准确，在肿瘤近侧1～2cm处作尿道切除、阴茎或会阴部尿道造口术较为合理。 2.B、C期肿瘤宜距离肿瘤1～2cm处作阴茎部分切除术。若不能获得满意的无瘤切缘，则施行阴茎切除及会阴部尿道造口术。切除原发肿瘤后，若肿大的腹股沟淋巴结不缩小，活检证实癌转移者，应行腹股沟深，浅淋巴结及盆腔淋巴结清除术。
3.尿道膜部或前列腺部的O、A期肿瘤，可经尿道行电切除。由于电切肿瘤往往不完全，且电切括约肌附近的肿瘤易发生尿失禁，以施行膀胱前列腺及全尿道切除术较为合理。且应同时行盆腔淋巴结清除术。活检证实腹股沟淋巴结转移者，亦应予以清除。
一般尿道球膜部肿瘤在确诊时往往已有广泛扩展，即使作根治手术，亦无法治愈。术后复发率高的原因是其邻近的耻骨下支、耻骨联合和盆底肌肉妨碍了对尿道球部肿瘤的局部广泛切除。若将肿瘤、下尿路、生殖系统以及上述结构作广泛整块切除，可提高治愈率。术前放疗可能有价值，但经验尚少。单纯放疗亦能使一些病人的肿瘤获得控制。